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Epitope mapping 서비스
Epitope mapping
Epitope mapping은 재조합 혹은 정제된 항체(antibody) 또는 혈청(serum)내 항체가 항원단백질의 어느 부위에 결합하는지 확인하는 것입니다.PEPperPRINT사의 특화된 PEPperCHIP 플랫폼 기술을 기반으로 기존 peptide를 합성해서 슬라이드에 결합시키는 것인 아닌 아미노산 프린터를 사용하여 슬라이드에 아미노산을 직접 인쇄하여 peptide array를 아래 그림과 같이 제작합니다. Peptide의 방향을 일정하게 하여 Epitope mapping의 정확도가 높습니다.
특장점
- 아미노산을 chip에 프린트 하듯이 펩타이드 합성
- 저렴한 비용, 빠른 분석
- 고밀도/고함량 chip (1,000 펩타이드/cm2)
- 동일 peptide에 대해 duplicate spot 생성 및 반복시험으로 결과의 신뢰도 최대화
- 한 슬라이드로 multi array 가능
- 15개 펩타이드로 14 overlap 하여 펩타이드 합성
고객준비사항
- 단백질서열
- - Array를 만들 서열(Antigen)
- Analyte
- - 항체, serum, ascites, 단백질 모두 확인 가능
- - 항체필요량
- · Linear epitope mapping : 20 ~ 30 ug (serum : 20 ~ 40 ul)
- · Conformational epitope mapping : 100 ~ 200 ug (Serum : 200 ~ 400 ul)
Epitope mapping 종류
- Linear epitope mapping
- Conformational epitope mapping
- Epitope substitution 스크리닝
- Cross-reactivity 스크리닝
- Discovery 스크리닝
Linear Epitope mapping
- 15개 펩타이드를 14 overlap 하여 합성
Conformational Epitope mapping
- Alpha-helix 구조와 유사한 loop 형태로 7개, 10개, 13개 펩타이드를 합성하여 확인
- Linear Epitope에서 확인 되지 않는 epitope가 Conformational epitope mapping에서 확인 가능
응용분야
- 항체 분석
(Cross-reactivity분석 + Epitope mapping + Epitope substitution Scan)- - 먼저, 개발한 항체와 Cross-reactivity가 있는 단백질을 HuProt® Human Proteome Microarray v4.0(21,000여개 이상의 모든 인간 단백질의 전체 sequence array)로 선별합니다. 선별된 단백질의 sequence를 overlap한 PEPperCHIP® Peptide Microarray로 epitope mapping을 진행해 항체와의 결합하는 epitope를 확인합니다. Epitope 심층분석을 위하여, epitope의 아미노산을 치환하는 PEPperMAP® Epitope Substitution Scan을 통해, 항체와 결합하는 epitope 서열의 특성을 분석하여 항체 유효성 검사 과정을 수행 할 수 있습니다.
- Biomarker Discovery
- - Viral proteome을 highly-overlapping한 Microarray에 여러 감염자의 혈청과 미감염자의 혈청 분석을 실시합니다.
감염자와 미감염자간의 혈청 내 항체가 붙는 epitope 분석을 통하여, immunodominant epitope를 확인 할 수 있습니다. 
- - Viral proteome을 highly-overlapping한 Microarray에 여러 감염자의 혈청과 미감염자의 혈청 분석을 실시합니다.
